l’ILTM offres un  Master en Théologie et un autre en Sciences religieuses, spécialement en relations islamo-chrétiennes. La formation dure deux années dont une consacrée aux séminaires de méthodologie et de spécialisation et la dernière au séminaire d’approfondissement et à la rédaction d’un mémoire, présenté en soutenance publique. Ce programme, qui devra être conduit en collaboration avec des institutions partenaires, notamment l’École de Mission et de Théologie (MHS) de Stavanger et d’autres, est ouvert aux titulaires d’une licence en théologie pour le Master en théologie (Mth), et d’une licence en théologie ou en sciences religieuses (histoire des religions) pour le Master en sciences religieuses (MA en sciences religieuses).